بدعم من الدولة الصفوية قاد تمرد شيعي رافضي رجلٌ يقال له بابا ذو النون في منطقة يوزغاد؛ حيث جمع هذا البابا ما بين ثلاثة آلاف وأربعة آلاف ثائر من مريديه، وفرض الخراجَ على المنطقة، وقَوِيت حركته حتى إنه استطاع هزيمة بعض القُواد العثمانيين الذين توجَّهوا لقمع حركته، ثم أرسل له السلطان سليمان القانوني حملةً عسكرية قضت عليه وقتلته، وأُرسِلَ رأسُه إلى إستانبول، ثم ظهر رجلٌ آخر يقال له قلندر جلبي في منطقتي قونية ومرعش، وكان عدد أتباعه ثلاثين ألف شيعي قاموا بقتل المسلمين السُّنَّة في هاتين المنطقتين، ويقول بعض المؤرخين إن قلندر جلبي جعل شعارَه أن من قتل مسلمًا سنِّيًّا واعتدى على امرأة سُنية يكون بهذا قد حاز أكبر الثواب، فتوجه بهرام باشا لقمع هذا العصيان، فقتله العصاة، ثم نجحت الحيلة معهم؛ إذ إن الصدر الأعظم إبراهيم باشا قد استمال بعض رجال قلندر جلبي، فقَلَّت قواته وهُزم وقُتِل بأيدي أهل السنة الذين أنهوا تمرُّده.