نفى محمد علي باشا حاكِمُ مِصرَ عُمَر مكرم نقيب الأشراف إلى دمياط على الرغم أنَّ مَكرم كان له دورٌ في تولية محمد علي شؤون البلاد، عندما قاد هو وعددٌ من مشائخ الأزهر ثورةً لخلع خورشيد بيك باشا سنة 1805م تولى بعدها محمد علي حكم مصر، وحينما استقَرَّت الأمور لمحمد علي خاف من نفوذ المشائخ، فنفى عمر مكرم إلى دمياط سنة 1809م, وأقام بها أربعةَ أعوام، ثم نقله إلى طنطا توفي فيها 1822م، وبذلك يكون محمد علي باشا قد انفرد بحُكم مصر بعد القضاءِ على الزعامة الشعبية التي كان يتزعَّمُها عمر مكرم.