حادثُ فاشودة كان من أسبابِ الخلافِ بين انجلترا وفرنسا في السيطرةِ على أعالي النيلِ، هو تصميمُ الخديوي إسماعيل على الوصولِ إلى أعماقِ الجنوب السوداني عند تأسيسِه مديرية خَطِّ الاستواء على حدودِ أوغندا ليسيطِرَ على كلِّ مجرى نهرِ النيل والامتداد في أعماقِ القارَّة. وقد أصبحت تلك المناطِقُ ضِمنَ الوجود المصري في السودانِ، وكانت الإمبراطوريةُ الفرنسيةُ بدَورِها تتحَرَّك باتجاهِ مَنطِقةِ جنوب السودان هي الأخرى؛ حيث كان القائِدُ الفرنسي مارشان قد وصل إلى فاشودة بعد عامين من خروجِه من مدينة برازافيل في الكونغو على رأسِ جنودِ سينغاليين مجتازًا ثلاثةَ آلاف كيلومتر في جوف القارة؛ بهَدَفِ ضَمِّ أعالي النيل إلى الإمبراطورية الفرنسية؛ لتلتقي قواتُه مع قواتِ كتشنر الذي كان بعد انتصارِه على الحركة المهدية واحتلالِ الخرطوم انطلق على مركَبٍ بخاري ومعه عددٌ من الجنود المصريين والسودانيين متَّجهًا إلى فاشودة، حيث وصل بعد يومين من وصولِ مارشان. وعندما التقى الطرفانِ أعلم كتشنر القائِدَ الفرنسي بأنَّ عليه العودةَ إلى بلاده وتَرْكَ فاشودة؛ لأن الأرض التي يَقِفون عليها هي أرضٌ مِصريَّةٌ، وأن الخِلافَ هو بين مصر وفرنسا، وقد استقبل كتشنر خَصمَه الفرنسي بلباسِ ضابطٍ مِصريٍّ، وتحت العلم المصري. كانت مرحلة صراعات بين الدُّوَلِ الاستعمارية حول السودان ومنطقةِ القرن الأفريقي ووسط أفريقيا. وكانت نقطةُ الالتقاءِ هي فاشودة التي انتهت بدونِ معركةٍ عَسكريةٍ، وكانت عنوانًا لتقسيم المنطقة وَفقَ نظرية الاتفاقاتِ الوُدِّية والتي تبلورت بعد سنواتٍ قليلةٍ فيما سمِّيَ بالاتفاق الوُدي لتقسيمِ الدُّوَل العربية أو المستعمرات بين الدُّوَل الاستعمارية! بعد صراعاتٍ حاولت فرنسا خلالَها هي الأخرى الاتصالَ بالثورة المهدية والطَّلَب منها رفعَ العَلَم الفرنسي فوقَ فاشودة قبل أن تقومَ بمساندة الثورة المهديَّة في مواجهة بريطانيا، وبعد مواجهةِ فاشودة انتهت الأوضاعُ إلى الاستقرار على تقسيم "السودان العظيم" إلى مناطِقِ نفوذ وقَعَ فيها السودان الحاليُّ الذى نعرفه تحتَ الاحتلال الانجليزي. أخذت إيطاليا (بيلول) شمال خليج (عصب)، والمنطقة الساحلية قرب (مصوع) إرتريا الحالية, وأخذت الحبشةَ مدينة (هرو)، وانتزعت إنجلترا الجهاتِ المطِلَّةَ على بحيرة فيكتوريا، ووضعت فيها أساسًا لمستعمرة أوغندا كمركزٍ لِمُستعمراتِها الأفريقيةِ، وأخرجت إنجلترا فرنسا من فاشودة تحت العَلَمِ والجيش المصري إلى المناطِقِ الأخرى في جوف القارة، وهى التي أصبحت تسيطِرُ على تشاد فعليًّا.