تمكَّنَ الجيشُ في اتحاد جُزر القُمُر مدعومًا بقوات من الاتحاد الأفريقي، من بَسطِ سيطرته على جزيرة أنجوان بعدَ عامٍ كاملٍ من قيام الكولونيل محمد بكر الذي كان يشغَلُ منصبَ رئيس الجزيرة، بالاستيلاءِ على الجزيرةِ وفَصلِها عن بقيةِ أجزاءِ الأرخبيلِ الواقعِ في المحيط الهندي، ويُعاني اتحاد جُزرِ القُمُر من نزاعاتٍ بين العاصمةِ موروني، والجُزُرِ الثلاثِ، وهي: القُمُر الكُبْرى، وأنجوان، وموهيلي، حيثُ تتمتَّعُ كلُّ واحدة منها بوجود مؤسَّساتِها الخاصَّةِ بها. وكانت أنجوان قد انفصَلَت في عامِ 1997م عن الاتحاد، ثم عادت إليه أواخرَ عامِ 2001م.